Una célula mínima contiene muchísima información funcional. ¿Cómo llegó allí? Los darwinistas, que desean explicar toda la vida sin apelar a un diseño, están obligados a creer que la información se crea a sí misma. En el pasado, tendían a ser más reticentes sobre el problema, al darse cuenta de que era un desafío tremendo incluso llegar a un replicador teórico. Últimamente, algunos de ellos están empleando una táctica más audaz: simplemente afirman que la información se crea a sí misma. Dos artículos recientes en las principales revistas ilustran la táctica, que a menudo incluye extender la selección natural hacia los reinos prebióticos donde no pertenece.
En Science Magazine, Aaron Wacholder y Anne-Ruxandra Carvunis hablan sobre cómo obtener «nuevos genes a partir de partes prestadas». En su artículo, la innovación es una palabra clave. Significa nueva información que puede realizar una función. ¿De dónde viene la innovación?
La vasta diversidad fenotípica de la vida es en parte consecuencia de un proceso continuo de innovación genética. Nuevos genes, con distintas estructuras y capacidades, surgen regularmente a lo largo de la historia evolutiva. [Énfasis añadido.]
Ahí está la afirmación. Surge la innovación. ¿Entiendo? Simplemente emerge. Emerge con regularidad. Es como decir, ¡créalo porque nosotros lo decimos!
Haciendo uso de las tecnologías de la genómica, los investigadores están comenzando a comprender los detalles de los procesos mediante los cuales surgen nuevos genes. En la página 797 de este número, Cosby et al. (1) proporcionan claridad para uno de esos procesos. Los transposones son elementos genómicos parásitos que se replican insertando copias de sí mismos en el genoma del huésped. Cosby y col. informan cómo los genes de los vertebrados han capturado dominios de transposones de ADN, generando nuevos genes que codifican nuevas proteínas de fusión con arquitecturas de dominio distintas. La fusión de dominios de transposones con genes del huésped parece ser frecuente, con 94 eventos de fusión identificados durante la evolución de los tetrápodos. La captura de dominios de transposones puede ser una fuente común de nuevos genes e innovación molecular en todo el árbol de la vida.
Mezcla de funciones existentes
Lo que Rachel Cosby et al. de hecho, demuestran en su artículo en Science que es solo un tipo mínimo de «innovación regulatoria». Su método se basa en la mezcla de funciones existentes en los transposones cuando se empalman con genes. Esto es tan inútil como obtener nuevos significados de párrafos de dos libros que se cortan y pegan de manera aleatoria.
Nuestros hallazgos confirman que la mezcla de exones es una fuerza evolutiva importante que genera novedad genética. Proporcionamos evidencia de que los transposones de ADN promueven la mezcla de exones insertando dominios de transposasa en nuevos contextos genómicos. Este proceso proporciona un camino plausible para la aparición de varios factores de transcripción antiguos con importantes funciones de desarrollo. Al ilustrar cómo un factor de transcripción y sus sitios de unión dispersos pueden emerger simultáneamente de una sola familia de transposones, nuestros resultados refuerzan la opinión de que los transposones son actores clave en la evolución de las redes reguladoras de genes.
El ejemplo específico que usan es una fusión de genes en un murciélago determinado, pero no describen una función novedosa de ningún significado, como el origen de un ala de murciélago o la ecolocalización. Eso está bien con ellos; simplemente llámelo una «gran fuerza evolutiva que genera una novedad genética». Créalo porque ellos lo dicen.
Aunque el nacimiento de genes a través de la duplicación se ha documentado ampliamente, la forma en que nacen las nuevas arquitecturas de proteínas y las funciones biológicas sigue siendo poco caracterizada. Aquí, validamos que la mezcla de exones es una fuerza evolutiva importante que genera novedad genética, y proporcionamos evidencia de que los transposones de ADN alimentan el proceso no solo al proporcionar dominios de proteínas para ensamblar nuevas arquitecturas de proteínas, sino también, en muchos casos, al introducir los sitios de empalme que posibilitan el proceso de fusión. Aunque estos eventos deben ser relativamente raros en una escala de tiempo evolutiva, la movilidad de los transposones de ADN probablemente aumenta la probabilidad de generar un gen funcional a través de la mezcla de exones mediante la introducción de material genético en nuevos contextos.
«Probable» y «Podría»
Una y otra vez en el periódico, las palabras de cobertura “probable” y “podría” funcionan para degradar la confianza en la afirmación. Su única evidencia de que ha surgido alguna función nueva es que los cambios parecen haberse conservado mediante una «selección purificadora». La palabra información ni siquiera aparece en el periódico.
Las afirmaciones más sorprendentes se encuentran en una figura en el análisis de Wachover y Carvunis del artículo de Cosby et al., Donde muestran seis procesos no guiados detrás del «origen de nuevos genes codificadores de proteínas». Primero están los mecanismos propuestos por Cosby et al., Que incluyen «captura de dominio de transposón» y «fusión de genes», seguidos de «divergencia extrema» y «mezcla de exones». Luego se basan en la «duplicación y divergencia» seguida de la afirmación más audaz de todas: «nacimiento de novo». Describen esto como «un gen completamente nuevo evoluciona a partir de una secuencia previamente no codificante».
En contraste con esta clase de nuevos mecanismos de formación de genes, en los que la innovación consiste en reorganizar dominios funcionales en nuevos contextos, el fenómeno del nacimiento de genes de novo a partir de una secuencia no genética genera dominios y genes completamente nuevos. Aunque alguna vez se pensó que eran raros, ahora se han informado casos bien caracterizados de nacimiento de genes de novo en numerosos taxones (9).
La referencia 9 lleva al lector a un artículo en PLOS Genetics, coautor de Carvunis nuevamente, donde los dos autores afirman que los genes huérfanos son ejemplos de genes nuevos que aparecieron de la nada. Hable sobre la mendicidad de la pregunta. ¡La misma evidencia que Paul Nelson usa para argumentar en contra de la evolución la usan para argumentar a favor de la evolución! Una vez más, no muestran ejemplos verdaderamente maravillosos como ojos o alas que evolucionan por casualidad de esta manera. Solo definen una «función» como algo que permanece en el genoma debido a la «selección purificadora». Otro de sus ejemplos de novedad en la función es, vea esto, el cáncer. Los lectores pueden consultar el documento de acceso abierto para ver si alguno de sus ejemplos de «genes de novo» realmente representa información que surge por casualidad.
Con respecto a los nuevos genes por duplicación, Casey Luskin ha abordado esa afirmación en detalle aquí y aquí. Ann Gauger y Douglas Axe también abordaron la afirmación en un artículo en BIO-Complexity. La conclusión es que la evolución ciega es ajena a funcionar. No va a almacenar mutaciones en una hebra inútil esperando a que dé con alguna innovación, como tampoco una sucesión de letras duplicadas va a encontrar un concepto nuevo e increíble.
Información emergente en el origen de la vida
Otra afirmación de que la información puede surgir espontáneamente se encuentra en un artículo en PNAS, de Patrick W. Kudella et al., Incluido Dieter Braun. Al igual que la historia de la duplicación de genes, este artículo afirma que «las secuencias estructuradas surgen de un conjunto aleatorio cuando se replican mediante ligadura con plantilla». Observe las afirmaciones seguras desde el principio:
La estructura de la vida surgió de la aleatoriedad. Esto se atribuye a la selección por evolución molecular darwiniana. Este estudio encontró que la ligadura con plantilla aleatoria conducía al alargamiento y selección de secuencia simultáneos de oligómeros. Las hebras de producto mostraron motivos de secuencia altamente estructurados que inhibieron el auto-plegado y construyeron redes de reacción de autoplantación. Mediante la reducción del espacio de secuencia, la cinética de formación de dúplex aumentó y condujo a una replicación más rápida a través del proceso de ligadura. Estos hallazgos implican que las propiedades de unión elementales de los nucleótidos pueden conducir a una selección temprana de secuencias incluso antes del inicio de la evolución darwiniana. Esto sugiere que tal simplificación del espacio de secuencia podría resultar en una selección aguas abajo más rápida para la función basada en secuencia para el origen de la vida.
Es difícil ser caritativo con esta revista. Los autores conocen muy bien el problema de la catástrofe de errores para las secuencias heredadas sin una estricta corrección de errores. También conocen la inmensidad del espacio secuencial no funcional. Saben que los genes son funcionales no por estructuras repetidas sino por información genética. Y, sin embargo, persiguen el escenario del mundo del ARN desgastado (ver aquí) con la noción de que la selección natural podría funcionar de alguna manera antes de que se disponga de una replicación precisa. El descaro de esta afirmación es asombroso:
Una de las hipótesis dominantes para explicar el origen de la vida es el concepto de mundo ARN. Se basa en el hecho de que las moléculas de ARN catalíticamente activas pueden promover enzimáticamente su propia replicación a través de sitios activos en sus estructuras tridimensionales. Estas denominadas ribozimas tienen una longitud mínima de 30 a 41 pares de bases y, por lo tanto, un espacio de secuencia de más de 430 ∼ 1018. El subconjunto de secuencias funcionales catalíticamente activas en este vasto espacio de secuencia es extremadamente pequeño, lo que hace que el ensamblaje espontáneo de ribozimas de monómeros u oligómeros casi imposibles.
Es imposible, ¡pero creen que sucedió! Tal credulidad empequeñece la fe del culto más engañado. Debido a que necesitan absolutamente algún tipo de selección darwiniana, simplemente afirman que estaba allí: «la evolución prebiótica probablemente ha proporcionado alguna forma de selección que guía a los nucleótidos individuales para formar secuencias funcionales y, por lo tanto, reduce la entropía de secuencia de este sistema». Es imposible; necesitamos selección; por lo tanto, debe haber existido. ¿Eh?
Oligonucleótidos de ligadura aleatoria
Su artículo se basa en una suposición similar a la fe en la duplicación de genes como fuente de innovación. Demuestran que los oligonucleótidos ligados aleatoriamente pueden formar estructuras repetidas. Esto reduce la entropía, dicen, y por lo tanto tales estructuras deben ser capaces de funcionar. Mire lo que saben que son obstáculos insuperables; luego mire lo que dicen que debe haber sucedido.
Para el surgimiento de la vida en la Tierra primitiva, los oligómeros necesitaban mostrar espontáneamente un comportamiento evolutivo y crear una estructura a partir de la aleatoriedad. Creemos que esto podría ser difícil para las reacciones de replicación base por base debido a la catástrofe del error Eigen. Las hebras emergentes son copias precisas de la hebra de la plantilla o se vuelven cada vez más aleatorias debido a los errores incorporados cada vez que se replica una hebra. Por lo tanto, el sistema pierde información y funciona con el tiempo. Sin embargo, incluso si la fidelidad de la replicación estuviera por debajo del umbral de error y las hebras replicadas fueran copias perfectas de la plantilla de hebra original, el surgimiento de una secuencia más apta a partir de un grupo inicial aleatorio requeriría una selección darwiniana de funciones en un espacio de secuencia potencialmente muy grande.
OK, se acabó el juego. Pueden irse a casa ahora. Pero espera, siempre hay fe.
En contraste, aquí, seguimos la ligadura con plantilla de un grupo de hebras aleatorias de 12 hechas a partir de dos bases bajo oscilaciones de temperatura. Tanto la cooperación de secuencias como el uso de la ligadura en lugar de la replicación base por base distingue este trabajo de la ref. 48 y conducen a secuencias ligadas que estaban muy estructuradas. Esas secuencias podrían seleccionarse físicamente por longitud utilizando diferencias de temperatura. Esta combinación de mecanismos tendría una dinámica muy similar a la evolución darwiniana.
A pesar de su minimalismo, el sistema estudiado contiene todos los elementos necesarios para la evolución darwiniana: condiciones fuera de equilibrio, transmisión de información de secuencia desde la plantilla a las cepas de sustrato, reproducción confiable de un subconjunto de productos oligoméricos y la posibilidad de seleccionar entre las secuencias largas de rápido crecimiento en el proceso. En los albores de la vida, tal dinámica predarwiniana habría empujado a los sistemas prebióticos hacia estados de entropía más baja. Una selección posterior para la función catalítica a partir de las secuencias estructuradas replicadas podría haber allanado el camino hacia el eventual surgimiento de la vida.
El descaro de los evolucionistas al creer cosas imposibles por aserción necesita ser avergonzado seriamente. Sería una vergüenza extrajudicial si la dictadura del lobby de Darwin no gobernara la ciencia.
Artículo originalmente publicado en inglés por Evolution News & Science Today
