Genetistas: Refiriéndose al genoma humano-chimpancé; hay “predicciones” no “hechos establecidos”

Las afirmaciones que flotan en Internet sobre la similitud de los genomas humanos y de los chimpancés son curiosamente exactas pero inconsistentes.

  • “¿Qué significa realmente tener un 99% de chimpancé?” (Smithsonian.com)
  • “Compartimos más del 98% de nuestro ADN y casi todos nuestros genes con nuestro pariente vivo más cercano, el chimpancé”. (Nature)
  • “[C]erca del 99 por ciento de nuestro ADN es idéntico al de los chimpancés”. (Kevin Williamson, National Review)

  • “La mayoría de los estudios indican que cuando se comparan las regiones genómicas entre los chimpancés y los humanos, comparten aproximadamente el 98,5 por ciento de la secuencia”. (Scientific American)
  • “Los humanos y los chimpancés comparten un sorprendente 98.8 por ciento de su ADN”. (Museo Americano de Historia Natural)
  • “[L]os humanos comparten aproximadamente el 99% de nuestro ADN con los chimpancés, convirtiéndolos en nuestros parientes vivos más cercanos”. (Science)
  • “Chimpancés, humanos, el 96 por ciento son los mismos, encuentra el estudio genético” (Noticias de National Geographic)

El genetista Richard Buggs de la Universidad Queen Mary de Londres, a quien conocimos anteriormente, realizó una extensa conversación sobre la pregunta en el foro de BioLogos. Cuando se le vio por última vez, en la misma arena, Buggs había llevado al evolucionista teísta Dennis Venema a dar marcha atrás sobre una afirmación en su libro Adam and the Genome [Adán y el genoma] contra una primera pareja humana.

¿Un “poco pedante”?
En un momento, Buggs centró la atención en la afirmación de Venema en su libro de que “nuestros genomas completos son aproximadamente 95 por ciento o idénticos en un 98 por ciento, dependiendo de cómo uno cuenta los efectos de las eliminaciones de pequeños bloques de ADN”. Él le preguntó a Venema para “corroborar su afirmación”, lo que generó una queja de Dennis de que Buggs estaba siendo un poco “pedante” y una disquisición cómica de Venema sobre el significado de la palabra “todo”.

La discusión se extiende a 133 publicaciones y se vuelve bastante complicado y técnico. Y ese, creo, es el punto. Buggs ha reproducido su publicación y resumen final en su sitio web. El escribe:

Recientemente participé en una discusión sobre el foro de BioLogos sobre el grado de similitud entre los genomas humano y de chimpancé. Me preguntó Dennis Venema sobre este tema, quien había encontrado una cita antigua en línea de un artículo periodístico que escribí en 2008 sobre este tema. En 2008, en un par de artículos de periódico, hice algunos cálculos simples basados ​​en el documento del genoma del chimpancé de 2005. Sobre la base de estos, he llegado a la sorprendente conclusión de que estos datos sugieren que los genomas humanos y de chimpancés en su totalidad podrían ser solo un 70% idénticos. Dennis Venema me preguntó si todavía era mi punto de vista. Puedes leer toda la discusión en inglés aquí. Es bastante largo, con muchas contribuciones tangenciales.

Te animo a leer la publicación completa.

Dentro de la fábrica de salchichas
Buggs nos da una mirada dentro de la fábrica de salchichas donde se calculan las cifras sobre el tema. Buscando la “evaluación actual más precisa”, aquí es cómo el propio Buggs haría alguno de los cálculos:

Para llegar a la evaluación actual más precisa que pude de la similitud entre el genoma humano y el chimpancé, descargué del sitio web de UCSC genomics las últimas alineaciones (realizadas con el software LASTZ) entre los ensamblajes del genoma humano y del chimpancé, hg38 y pantro6 . Ver la publicación de discusión # 35 para más detalles. Esto dio lo siguiente para el genoma humano:

4,06% no tenía alineación con el ensamblaje de chimpancé
5.18% estaba en CNV en relación con el chimpancé
1.12% difirió debido a los SNP en las regiones mejor alineadas uno a uno
0.28% difirió debido a indeles dentro de las regiones mejor alineadas uno a uno

El porcentaje de nucleótidos en el genoma humano que tuvo coincidencias exactas uno a uno en el genoma del chimpancé fue 84.38%

Con el fin de evaluar cómo las mejoras en los ensamblajes del genoma pueden cambiar estas cifras, hice los mismos análisis sobre la alineación del ensamblaje anterior PanTro4 contra Hg38 (ver la publicación de discusión n. ° 40). El ensamblaje de Pantro4 se basó en una secuencia mucho más pequeña que del ensamblaje de Pantro6 (vea la publicación de discusión n. ° 39). En esta alineación de Pantro4:

6.29% no tenía alineación con el ensamblaje de chimpancé
5,01% estaba en CNV en relación con el chimpancé
1.11% difirió debido a los SNP en las regiones mejor alineadas uno a uno
0.28% difirió debido a indeles dentro de las regiones mejor alineadas uno a uno

El porcentaje de nucleótidos en el genoma humano que tenía coincidencias exactas uno a uno en el genoma del chimpancé fue del 82,34%.

Aunque rechazó la predicción que él mismo hizo en 2008, basado en el artículo de 2005, ahora da su conclusión:

Como el 5% del genoma humano aún está desarmado, y el 5% parece ser CNV en relación con el chimpancé, y el 4% no está alineado con el genoma del chimpancé, no puedo estar de acuerdo con Dennis Venema [aquí] y Steve Schaffner [aquí] que “95 % es la mejor estimación que tenemos para la identidad de chimpancés y humanos en todo el genoma “. Aceptaría el 95% como una predicción, pero no como una declaración de hecho establecido.

Predigo que la cifra del 95% probará estar equivocada, porque (sobre la base de mi comparación de las alineaciones PanTro4 y PanTro6 con Hg38) creo que las diferencias de la CNV llegaron para quedarse, y dudo que todos los actualmente no alineados o las regiones no secuenciadas del genoma humano demostrarán que todas son 95% iguales al genoma del chimpancé. Algunas de las secuencias humanas “desalineadas” son indeles de tamaño medio, y es difícil ver por qué no se hubieran ensamblado en el chimpancé si estuvieran presentes. También espero que al menos algunas de estas secuencias desalineadas o no secuenciadas evolucionen rápidamente.

En resumen, a pesar de la impresión que obtendría de una búsqueda en Google sobre el tema, todavía no existe un “hecho establecido” que cuantifique la similitud genómica humano-chimpancé.

¿Qué tan alto?
Basándose solo en similitudes fisiológicas indudables, ya sea por descendencia común o diseño común, cualquiera que deambule fuera de la calle esperaría naturalmente que el porcentaje sea alto. Pero ¿qué tan alto? Hay predicciones, pero con los datos aún incompletos, no se conoce ningún “hecho”.

Las afirmaciones de Glib en los medios, incluidos los medios científicos, incluso por los propios científicos, deben considerarse con escepticismo, y no menos la afirmación patentemente absurda de que somos “99% chimpancés”. (Sí, puedes conseguir una camiseta con ese emblema.) Pero ¿por qué crees que los medios y muchos científicos insisten en llevar al público a pensar que la pregunta es más simple de lo que realmente es? Esa es una pregunta interesante, no una que la genética pueda responder.


Artículo publicado originalmente en inglés por David Klinghoffer

Crédito de la foto: República, a través de Pixabay.